Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD47Q08722 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD47Q08722 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD47Q08722 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD47Q08722 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD47Q08722 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD47Q08722 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CD47Q08722 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD47Q08722 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD47Q08722 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD47Q08722 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD47Q08722 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD47Q08722 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD47Q08722 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD47Q08722 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD47Q08722 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD47Q08722 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD47Q08722 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD47Q08722 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CD47Q08722 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CD47Q08722 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD47Q08722 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD47Q08722 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD47Q08722 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD47Q08722 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD47Q08722 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD47Q08722 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CD47Q08722 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD47Q08722 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD47Q08722 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD47Q08722 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD47Q08722 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD47Q08722 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD47Q08722 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD47Q08722 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CD47Q08722 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CD47Q08722 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CD47Q08722 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CD47Q08722 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CD47Q08722 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CD47Q08722 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CD47Q08722 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CD47Q08722 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
CD47Q08722 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CD47Q08722 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CD47Q08722 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD47Q08722 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD47Q08722 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD47Q08722 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD47Q08722 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD47Q08722 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD47Q08722 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD47Q08722 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD47Q08722 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD47Q08722 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD47Q08722 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD47Q08722 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD47Q08722 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD47Q08722 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD47Q08722 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD47Q08722 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD47Q08722 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CD47Q08722 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD47Q08722 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CD47Q08722 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD47Q08722 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD47Q08722 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD47Q08722 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD47Q08722 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD47Q08722 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD47Q08722 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD47Q08722 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD47Q08722 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD47Q08722 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD47Q08722 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD47Q08722 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD47Q08722 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD47Q08722 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD47Q08722 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD47Q08722 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD47Q08722 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD47Q08722 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD47Q08722 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD47Q08722 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD47Q08722 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD47Q08722 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD47Q08722 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD47Q08722 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD47Q08722 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD47Q08722 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD47Q08722 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD47Q08722 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD47Q08722 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CD47Q08722 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CD47Q08722 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD47Q08722 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD47Q08722 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD47Q08722 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD47Q08722 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD47Q08722 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms