Protein–RNA interactions for Protein: Q07820

MCL1, Induced myeloid leukemia cell differentiation protein Mcl-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCL1Q07820 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCL1Q07820 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCL1Q07820 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCL1Q07820 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCL1Q07820 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCL1Q07820 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCL1Q07820 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCL1Q07820 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCL1Q07820 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCL1Q07820 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCL1Q07820 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCL1Q07820 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCL1Q07820 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCL1Q07820 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCL1Q07820 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCL1Q07820 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCL1Q07820 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCL1Q07820 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCL1Q07820 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCL1Q07820 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCL1Q07820 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCL1Q07820 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
MCL1Q07820 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MCL1Q07820 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms