Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK18Q07002 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDK18Q07002 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms