Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTDSPL2Q05D32 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTDSPL2Q05D32 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTDSPL2Q05D32 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTDSPL2Q05D32 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTDSPL2Q05D32 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTDSPL2Q05D32 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTDSPL2Q05D32 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTDSPL2Q05D32 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTDSPL2Q05D32 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CTDSPL2Q05D32 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CTDSPL2Q05D32 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTDSPL2Q05D32 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTDSPL2Q05D32 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTDSPL2Q05D32 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTDSPL2Q05D32 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTDSPL2Q05D32 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTDSPL2Q05D32 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTDSPL2Q05D32 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTDSPL2Q05D32 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTDSPL2Q05D32 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTDSPL2Q05D32 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTDSPL2Q05D32 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTDSPL2Q05D32 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTDSPL2Q05D32 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTDSPL2Q05D32 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTDSPL2Q05D32 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTDSPL2Q05D32 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTDSPL2Q05D32 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTDSPL2Q05D32 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CTDSPL2Q05D32 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTDSPL2Q05D32 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTDSPL2Q05D32 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTDSPL2Q05D32 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTDSPL2Q05D32 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTDSPL2Q05D32 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTDSPL2Q05D32 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTDSPL2Q05D32 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTDSPL2Q05D32 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTDSPL2Q05D32 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CTDSPL2Q05D32 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTDSPL2Q05D32 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTDSPL2Q05D32 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTDSPL2Q05D32 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTDSPL2Q05D32 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTDSPL2Q05D32 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTDSPL2Q05D32 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTDSPL2Q05D32 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTDSPL2Q05D32 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTDSPL2Q05D32 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTDSPL2Q05D32 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTDSPL2Q05D32 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTDSPL2Q05D32 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTDSPL2Q05D32 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTDSPL2Q05D32 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTDSPL2Q05D32 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTDSPL2Q05D32 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTDSPL2Q05D32 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CTDSPL2Q05D32 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTDSPL2Q05D32 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTDSPL2Q05D32 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTDSPL2Q05D32 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTDSPL2Q05D32 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTDSPL2Q05D32 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTDSPL2Q05D32 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTDSPL2Q05D32 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTDSPL2Q05D32 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTDSPL2Q05D32 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTDSPL2Q05D32 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTDSPL2Q05D32 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTDSPL2Q05D32 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTDSPL2Q05D32 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTDSPL2Q05D32 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTDSPL2Q05D32 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTDSPL2Q05D32 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTDSPL2Q05D32 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTDSPL2Q05D32 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTDSPL2Q05D32 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTDSPL2Q05D32 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTDSPL2Q05D32 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CTDSPL2Q05D32 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTDSPL2Q05D32 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTDSPL2Q05D32 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTDSPL2Q05D32 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTDSPL2Q05D32 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTDSPL2Q05D32 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CTDSPL2Q05D32 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTDSPL2Q05D32 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTDSPL2Q05D32 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTDSPL2Q05D32 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTDSPL2Q05D32 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CTDSPL2Q05D32 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTDSPL2Q05D32 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTDSPL2Q05D32 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTDSPL2Q05D32 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CTDSPL2Q05D32 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTDSPL2Q05D32 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTDSPL2Q05D32 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CTDSPL2Q05D32 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTDSPL2Q05D32 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms