Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNP2Q05952 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNP2Q05952 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNP2Q05952 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNP2Q05952 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNP2Q05952 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNP2Q05952 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNP2Q05952 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNP2Q05952 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNP2Q05952 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNP2Q05952 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNP2Q05952 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNP2Q05952 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNP2Q05952 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNP2Q05952 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNP2Q05952 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNP2Q05952 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNP2Q05952 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TNP2Q05952 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TNP2Q05952 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNP2Q05952 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNP2Q05952 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNP2Q05952 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TNP2Q05952 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNP2Q05952 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNP2Q05952 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNP2Q05952 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNP2Q05952 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNP2Q05952 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNP2Q05952 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNP2Q05952 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNP2Q05952 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNP2Q05952 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNP2Q05952 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNP2Q05952 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNP2Q05952 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNP2Q05952 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNP2Q05952 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNP2Q05952 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TNP2Q05952 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNP2Q05952 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNP2Q05952 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNP2Q05952 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNP2Q05952 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNP2Q05952 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNP2Q05952 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNP2Q05952 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNP2Q05952 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNP2Q05952 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNP2Q05952 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNP2Q05952 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNP2Q05952 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TNP2Q05952 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNP2Q05952 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNP2Q05952 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNP2Q05952 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TNP2Q05952 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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TNP2Q05952 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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TNP2Q05952 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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TNP2Q05952 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNP2Q05952 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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