Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPN12Q05209 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPN12Q05209 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPN12Q05209 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPN12Q05209 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPN12Q05209 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPN12Q05209 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTPN12Q05209 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPN12Q05209 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPN12Q05209 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPN12Q05209 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPN12Q05209 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPN12Q05209 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPN12Q05209 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPN12Q05209 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPN12Q05209 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPN12Q05209 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPN12Q05209 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPN12Q05209 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPN12Q05209 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPN12Q05209 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPN12Q05209 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPN12Q05209 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPN12Q05209 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPN12Q05209 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPN12Q05209 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPN12Q05209 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPN12Q05209 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPN12Q05209 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPN12Q05209 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPN12Q05209 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPN12Q05209 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPN12Q05209 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPN12Q05209 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPN12Q05209 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPN12Q05209 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPN12Q05209 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPN12Q05209 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPN12Q05209 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPN12Q05209 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPN12Q05209 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPN12Q05209 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPN12Q05209 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPN12Q05209 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPN12Q05209 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPN12Q05209 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPN12Q05209 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPN12Q05209 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPN12Q05209 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPN12Q05209 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPN12Q05209 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPN12Q05209 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPN12Q05209 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPN12Q05209 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPN12Q05209 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPN12Q05209 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPN12Q05209 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPN12Q05209 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTPN12Q05209 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTPN12Q05209 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTPN12Q05209 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPN12Q05209 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPN12Q05209 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPN12Q05209 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPN12Q05209 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPN12Q05209 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPN12Q05209 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPN12Q05209 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPN12Q05209 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPN12Q05209 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPN12Q05209 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPN12Q05209 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPN12Q05209 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPN12Q05209 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPN12Q05209 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPN12Q05209 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPN12Q05209 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPN12Q05209 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPN12Q05209 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPN12Q05209 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPN12Q05209 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPN12Q05209 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPN12Q05209 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPN12Q05209 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPN12Q05209 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPN12Q05209 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPN12Q05209 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPN12Q05209 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPN12Q05209 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPN12Q05209 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPN12Q05209 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPN12Q05209 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPN12Q05209 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPN12Q05209 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPN12Q05209 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPN12Q05209 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPN12Q05209 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPN12Q05209 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPN12Q05209 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPN12Q05209 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms