Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSC2Q02487 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSC2Q02487 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms