Protein–RNA interactions for Protein: Q02446

SP4, Transcription factor Sp4, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP4Q02446 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SP4Q02446 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SP4Q02446 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SP4Q02446 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SP4Q02446 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SP4Q02446 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SP4Q02446 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SP4Q02446 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SP4Q02446 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SP4Q02446 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SP4Q02446 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SP4Q02446 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SP4Q02446 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SP4Q02446 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SP4Q02446 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SP4Q02446 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SP4Q02446 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SP4Q02446 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SP4Q02446 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SP4Q02446 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SP4Q02446 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SP4Q02446 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SP4Q02446 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SP4Q02446 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SP4Q02446 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SP4Q02446 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SP4Q02446 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SP4Q02446 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SP4Q02446 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SP4Q02446 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SP4Q02446 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SP4Q02446 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SP4Q02446 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SP4Q02446 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SP4Q02446 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SP4Q02446 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SP4Q02446 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SP4Q02446 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SP4Q02446 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SP4Q02446 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SP4Q02446 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SP4Q02446 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SP4Q02446 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SP4Q02446 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SP4Q02446 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SP4Q02446 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SP4Q02446 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SP4Q02446 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SP4Q02446 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SP4Q02446 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SP4Q02446 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SP4Q02446 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SP4Q02446 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SP4Q02446 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SP4Q02446 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SP4Q02446 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SP4Q02446 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SP4Q02446 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SP4Q02446 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SP4Q02446 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SP4Q02446 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SP4Q02446 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SP4Q02446 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SP4Q02446 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SP4Q02446 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SP4Q02446 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SP4Q02446 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SP4Q02446 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SP4Q02446 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SP4Q02446 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SP4Q02446 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SP4Q02446 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SP4Q02446 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SP4Q02446 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SP4Q02446 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SP4Q02446 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SP4Q02446 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SP4Q02446 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SP4Q02446 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SP4Q02446 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SP4Q02446 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SP4Q02446 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SP4Q02446 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SP4Q02446 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SP4Q02446 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SP4Q02446 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SP4Q02446 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SP4Q02446 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SP4Q02446 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SP4Q02446 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SP4Q02446 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SP4Q02446 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SP4Q02446 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SP4Q02446 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SP4Q02446 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SP4Q02446 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SP4Q02446 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SP4Q02446 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SP4Q02446 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SP4Q02446 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms