Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDR2Q01850 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDR2Q01850 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms