Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MC1RQ01726 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MC1RQ01726 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MC1RQ01726 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MC1RQ01726 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MC1RQ01726 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
MC1RQ01726 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MC1RQ01726 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MC1RQ01726 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MC1RQ01726 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
MC1RQ01726 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MC1RQ01726 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MC1RQ01726 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MC1RQ01726 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MC1RQ01726 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MC1RQ01726 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MC1RQ01726 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
MC1RQ01726 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MC1RQ01726 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MC1RQ01726 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MC1RQ01726 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MC1RQ01726 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MC1RQ01726 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MC1RQ01726 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MC1RQ01726 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MC1RQ01726 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MC1RQ01726 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MC1RQ01726 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MC1RQ01726 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MC1RQ01726 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MC1RQ01726 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MC1RQ01726 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MC1RQ01726 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MC1RQ01726 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MC1RQ01726 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MC1RQ01726 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MC1RQ01726 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MC1RQ01726 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MC1RQ01726 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MC1RQ01726 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MC1RQ01726 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MC1RQ01726 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MC1RQ01726 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MC1RQ01726 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MC1RQ01726 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MC1RQ01726 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MC1RQ01726 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MC1RQ01726 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MC1RQ01726 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MC1RQ01726 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MC1RQ01726 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MC1RQ01726 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MC1RQ01726 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MC1RQ01726 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MC1RQ01726 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MC1RQ01726 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MC1RQ01726 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MC1RQ01726 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MC1RQ01726 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MC1RQ01726 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MC1RQ01726 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MC1RQ01726 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MC1RQ01726 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MC1RQ01726 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MC1RQ01726 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MC1RQ01726 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MC1RQ01726 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MC1RQ01726 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MC1RQ01726 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MC1RQ01726 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MC1RQ01726 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MC1RQ01726 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MC1RQ01726 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MC1RQ01726 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MC1RQ01726 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms