Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDK16Q00536 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDK16Q00536 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK16Q00536 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK16Q00536 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK16Q00536 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK16Q00536 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK16Q00536 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK16Q00536 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK16Q00536 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK16Q00536 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK16Q00536 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK16Q00536 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK16Q00536 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK16Q00536 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK16Q00536 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDK16Q00536 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK16Q00536 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK16Q00536 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK16Q00536 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK16Q00536 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK16Q00536 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK16Q00536 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK16Q00536 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDK16Q00536 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK16Q00536 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK16Q00536 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK16Q00536 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK16Q00536 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK16Q00536 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK16Q00536 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK16Q00536 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK16Q00536 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK16Q00536 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK16Q00536 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDK16Q00536 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms