Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUCB2P80303 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUCB2P80303 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUCB2P80303 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUCB2P80303 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUCB2P80303 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUCB2P80303 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NUCB2P80303 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUCB2P80303 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUCB2P80303 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUCB2P80303 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUCB2P80303 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NUCB2P80303 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUCB2P80303 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUCB2P80303 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUCB2P80303 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUCB2P80303 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NUCB2P80303 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUCB2P80303 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUCB2P80303 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUCB2P80303 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NUCB2P80303 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NUCB2P80303 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NUCB2P80303 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUCB2P80303 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUCB2P80303 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUCB2P80303 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NUCB2P80303 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NUCB2P80303 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NUCB2P80303 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUCB2P80303 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUCB2P80303 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUCB2P80303 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUCB2P80303 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NUCB2P80303 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUCB2P80303 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUCB2P80303 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUCB2P80303 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUCB2P80303 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUCB2P80303 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUCB2P80303 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUCB2P80303 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NUCB2P80303 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUCB2P80303 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUCB2P80303 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUCB2P80303 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUCB2P80303 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUCB2P80303 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NUCB2P80303 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUCB2P80303 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUCB2P80303 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUCB2P80303 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUCB2P80303 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUCB2P80303 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUCB2P80303 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUCB2P80303 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUCB2P80303 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUCB2P80303 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUCB2P80303 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NUCB2P80303 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NUCB2P80303 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUCB2P80303 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUCB2P80303 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUCB2P80303 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUCB2P80303 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUCB2P80303 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUCB2P80303 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUCB2P80303 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUCB2P80303 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUCB2P80303 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUCB2P80303 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUCB2P80303 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUCB2P80303 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUCB2P80303 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUCB2P80303 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUCB2P80303 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUCB2P80303 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUCB2P80303 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUCB2P80303 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUCB2P80303 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUCB2P80303 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUCB2P80303 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUCB2P80303 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUCB2P80303 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUCB2P80303 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUCB2P80303 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NUCB2P80303 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUCB2P80303 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUCB2P80303 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUCB2P80303 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUCB2P80303 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NUCB2P80303 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NUCB2P80303 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NUCB2P80303 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NUCB2P80303 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUCB2P80303 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUCB2P80303 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUCB2P80303 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUCB2P80303 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUCB2P80303 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms