Protein–RNA interactions for Protein: P78396

CCNA1, Cyclin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA1P78396 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNA1P78396 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNA1P78396 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNA1P78396 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNA1P78396 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNA1P78396 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNA1P78396 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNA1P78396 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNA1P78396 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNA1P78396 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNA1P78396 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNA1P78396 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNA1P78396 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNA1P78396 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNA1P78396 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNA1P78396 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNA1P78396 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNA1P78396 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNA1P78396 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNA1P78396 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNA1P78396 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNA1P78396 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNA1P78396 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNA1P78396 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNA1P78396 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNA1P78396 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNA1P78396 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNA1P78396 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNA1P78396 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNA1P78396 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNA1P78396 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNA1P78396 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNA1P78396 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNA1P78396 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNA1P78396 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNA1P78396 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNA1P78396 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNA1P78396 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNA1P78396 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNA1P78396 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNA1P78396 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNA1P78396 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNA1P78396 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNA1P78396 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNA1P78396 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNA1P78396 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNA1P78396 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNA1P78396 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNA1P78396 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNA1P78396 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNA1P78396 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNA1P78396 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCNA1P78396 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNA1P78396 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNA1P78396 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNA1P78396 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNA1P78396 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNA1P78396 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNA1P78396 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNA1P78396 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNA1P78396 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNA1P78396 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNA1P78396 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNA1P78396 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNA1P78396 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNA1P78396 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNA1P78396 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNA1P78396 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNA1P78396 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNA1P78396 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNA1P78396 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNA1P78396 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNA1P78396 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNA1P78396 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNA1P78396 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNA1P78396 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNA1P78396 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNA1P78396 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNA1P78396 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNA1P78396 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNA1P78396 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNA1P78396 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNA1P78396 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNA1P78396 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNA1P78396 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNA1P78396 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNA1P78396 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNA1P78396 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCNA1P78396 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNA1P78396 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNA1P78396 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNA1P78396 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNA1P78396 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNA1P78396 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNA1P78396 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNA1P78396 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNA1P78396 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNA1P78396 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNA1P78396 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCNA1P78396 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms