Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLDN10P78369 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLDN10P78369 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLDN10P78369 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDN10P78369 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDN10P78369 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDN10P78369 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDN10P78369 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDN10P78369 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDN10P78369 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDN10P78369 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDN10P78369 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDN10P78369 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDN10P78369 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDN10P78369 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDN10P78369 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDN10P78369 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDN10P78369 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDN10P78369 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN10P78369 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN10P78369 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN10P78369 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN10P78369 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN10P78369 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN10P78369 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN10P78369 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN10P78369 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN10P78369 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN10P78369 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN10P78369 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN10P78369 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN10P78369 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN10P78369 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN10P78369 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN10P78369 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN10P78369 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN10P78369 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN10P78369 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN10P78369 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN10P78369 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN10P78369 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN10P78369 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN10P78369 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN10P78369 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN10P78369 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN10P78369 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN10P78369 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN10P78369 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN10P78369 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN10P78369 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN10P78369 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN10P78369 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CLDN10P78369 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDN10P78369 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDN10P78369 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDN10P78369 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDN10P78369 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDN10P78369 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDN10P78369 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDN10P78369 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDN10P78369 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDN10P78369 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDN10P78369 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDN10P78369 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDN10P78369 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDN10P78369 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDN10P78369 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDN10P78369 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDN10P78369 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN10P78369 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN10P78369 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN10P78369 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN10P78369 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN10P78369 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN10P78369 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN10P78369 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN10P78369 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN10P78369 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN10P78369 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN10P78369 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN10P78369 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN10P78369 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN10P78369 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN10P78369 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN10P78369 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN10P78369 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN10P78369 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN10P78369 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN10P78369 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN10P78369 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN10P78369 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN10P78369 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN10P78369 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN10P78369 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN10P78369 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN10P78369 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN10P78369 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN10P78369 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN10P78369 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN10P78369 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms