Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPC5P78333 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPC5P78333 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPC5P78333 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPC5P78333 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPC5P78333 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPC5P78333 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPC5P78333 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPC5P78333 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPC5P78333 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPC5P78333 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPC5P78333 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPC5P78333 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPC5P78333 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPC5P78333 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPC5P78333 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPC5P78333 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPC5P78333 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPC5P78333 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPC5P78333 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GPC5P78333 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPC5P78333 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPC5P78333 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPC5P78333 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPC5P78333 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPC5P78333 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPC5P78333 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GPC5P78333 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPC5P78333 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPC5P78333 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPC5P78333 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPC5P78333 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPC5P78333 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPC5P78333 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPC5P78333 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPC5P78333 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GPC5P78333 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPC5P78333 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GPC5P78333 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPC5P78333 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPC5P78333 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPC5P78333 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPC5P78333 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPC5P78333 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPC5P78333 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPC5P78333 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPC5P78333 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPC5P78333 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPC5P78333 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPC5P78333 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPC5P78333 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPC5P78333 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPC5P78333 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPC5P78333 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GPC5P78333 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GPC5P78333 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPC5P78333 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPC5P78333 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPC5P78333 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPC5P78333 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GPC5P78333 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPC5P78333 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPC5P78333 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPC5P78333 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPC5P78333 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPC5P78333 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPC5P78333 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPC5P78333 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPC5P78333 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPC5P78333 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPC5P78333 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPC5P78333 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPC5P78333 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPC5P78333 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GPC5P78333 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPC5P78333 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPC5P78333 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPC5P78333 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPC5P78333 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPC5P78333 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GPC5P78333 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
GPC5P78333 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GPC5P78333 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPC5P78333 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPC5P78333 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPC5P78333 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPC5P78333 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPC5P78333 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPC5P78333 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPC5P78333 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPC5P78333 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPC5P78333 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPC5P78333 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPC5P78333 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPC5P78333 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPC5P78333 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPC5P78333 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPC5P78333 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPC5P78333 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPC5P78333 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms