Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCDC1P59894 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCDC1P59894 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCDC1P59894 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCDC1P59894 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCDC1P59894 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCDC1P59894 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCDC1P59894 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCDC1P59894 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DCDC1P59894 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
DCDC1P59894 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCDC1P59894 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCDC1P59894 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCDC1P59894 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
DCDC1P59894 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCDC1P59894 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCDC1P59894 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCDC1P59894 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCDC1P59894 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCDC1P59894 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DCDC1P59894 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCDC1P59894 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
DCDC1P59894 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCDC1P59894 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCDC1P59894 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCDC1P59894 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCDC1P59894 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCDC1P59894 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
DCDC1P59894 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCDC1P59894 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCDC1P59894 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DCDC1P59894 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCDC1P59894 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCDC1P59894 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCDC1P59894 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCDC1P59894 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCDC1P59894 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCDC1P59894 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCDC1P59894 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCDC1P59894 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCDC1P59894 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
DCDC1P59894 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCDC1P59894 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DCDC1P59894 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCDC1P59894 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCDC1P59894 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCDC1P59894 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCDC1P59894 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCDC1P59894 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCDC1P59894 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCDC1P59894 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCDC1P59894 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCDC1P59894 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
DCDC1P59894 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCDC1P59894 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCDC1P59894 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCDC1P59894 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCDC1P59894 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCDC1P59894 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCDC1P59894 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCDC1P59894 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCDC1P59894 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCDC1P59894 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCDC1P59894 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCDC1P59894 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCDC1P59894 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCDC1P59894 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCDC1P59894 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCDC1P59894 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCDC1P59894 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCDC1P59894 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCDC1P59894 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCDC1P59894 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCDC1P59894 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCDC1P59894 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCDC1P59894 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCDC1P59894 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCDC1P59894 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCDC1P59894 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCDC1P59894 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCDC1P59894 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCDC1P59894 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCDC1P59894 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCDC1P59894 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
DCDC1P59894 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
DCDC1P59894 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCDC1P59894 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCDC1P59894 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCDC1P59894 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCDC1P59894 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCDC1P59894 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCDC1P59894 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCDC1P59894 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCDC1P59894 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCDC1P59894 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
DCDC1P59894 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCDC1P59894 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCDC1P59894 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCDC1P59894 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCDC1P59894 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms