Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CHMP4BP1P59074 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP4BP1P59074 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms