Protein–RNA interactions for Protein: P58557

YBEY, Endoribonuclease YbeY, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBEYP58557 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YBEYP58557 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
YBEYP58557 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
YBEYP58557 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
YBEYP58557 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
YBEYP58557 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
YBEYP58557 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
YBEYP58557 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
YBEYP58557 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
YBEYP58557 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
YBEYP58557 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
YBEYP58557 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
YBEYP58557 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
YBEYP58557 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
YBEYP58557 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
YBEYP58557 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
YBEYP58557 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
YBEYP58557 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
YBEYP58557 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
YBEYP58557 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
YBEYP58557 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
YBEYP58557 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
YBEYP58557 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
YBEYP58557 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
YBEYP58557 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
YBEYP58557 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
YBEYP58557 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
YBEYP58557 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YBEYP58557 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YBEYP58557 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YBEYP58557 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YBEYP58557 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
YBEYP58557 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YBEYP58557 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YBEYP58557 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
YBEYP58557 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
YBEYP58557 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
YBEYP58557 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YBEYP58557 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
YBEYP58557 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YBEYP58557 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YBEYP58557 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YBEYP58557 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YBEYP58557 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YBEYP58557 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
YBEYP58557 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
YBEYP58557 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
YBEYP58557 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YBEYP58557 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
YBEYP58557 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YBEYP58557 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YBEYP58557 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YBEYP58557 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YBEYP58557 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YBEYP58557 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YBEYP58557 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YBEYP58557 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
YBEYP58557 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YBEYP58557 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
YBEYP58557 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YBEYP58557 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YBEYP58557 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
YBEYP58557 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YBEYP58557 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YBEYP58557 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
YBEYP58557 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YBEYP58557 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YBEYP58557 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YBEYP58557 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YBEYP58557 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YBEYP58557 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YBEYP58557 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
YBEYP58557 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YBEYP58557 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
YBEYP58557 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
YBEYP58557 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
YBEYP58557 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
YBEYP58557 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YBEYP58557 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YBEYP58557 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
YBEYP58557 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
YBEYP58557 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
YBEYP58557 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YBEYP58557 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
YBEYP58557 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
YBEYP58557 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
YBEYP58557 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
YBEYP58557 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
YBEYP58557 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
YBEYP58557 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
YBEYP58557 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
YBEYP58557 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
YBEYP58557 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
YBEYP58557 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
YBEYP58557 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
YBEYP58557 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
YBEYP58557 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
YBEYP58557 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
YBEYP58557 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
YBEYP58557 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms