Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SH3BGRP55822 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SH3BGRP55822 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SH3BGRP55822 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SH3BGRP55822 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SH3BGRP55822 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SH3BGRP55822 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SH3BGRP55822 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SH3BGRP55822 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SH3BGRP55822 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SH3BGRP55822 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SH3BGRP55822 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SH3BGRP55822 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SH3BGRP55822 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SH3BGRP55822 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SH3BGRP55822 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SH3BGRP55822 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SH3BGRP55822 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SH3BGRP55822 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SH3BGRP55822 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SH3BGRP55822 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SH3BGRP55822 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SH3BGRP55822 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SH3BGRP55822 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SH3BGRP55822 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SH3BGRP55822 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SH3BGRP55822 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SH3BGRP55822 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SH3BGRP55822 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SH3BGRP55822 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SH3BGRP55822 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SH3BGRP55822 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SH3BGRP55822 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SH3BGRP55822 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SH3BGRP55822 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SH3BGRP55822 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SH3BGRP55822 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SH3BGRP55822 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SH3BGRP55822 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SH3BGRP55822 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SH3BGRP55822 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SH3BGRP55822 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SH3BGRP55822 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SH3BGRP55822 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SH3BGRP55822 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SH3BGRP55822 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SH3BGRP55822 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SH3BGRP55822 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SH3BGRP55822 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SH3BGRP55822 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SH3BGRP55822 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SH3BGRP55822 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SH3BGRP55822 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SH3BGRP55822 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SH3BGRP55822 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SH3BGRP55822 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SH3BGRP55822 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SH3BGRP55822 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SH3BGRP55822 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SH3BGRP55822 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SH3BGRP55822 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SH3BGRP55822 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SH3BGRP55822 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SH3BGRP55822 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SH3BGRP55822 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SH3BGRP55822 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SH3BGRP55822 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SH3BGRP55822 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SH3BGRP55822 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SH3BGRP55822 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SH3BGRP55822 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SH3BGRP55822 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SH3BGRP55822 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SH3BGRP55822 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SH3BGRP55822 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SH3BGRP55822 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SH3BGRP55822 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SH3BGRP55822 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SH3BGRP55822 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SH3BGRP55822 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SH3BGRP55822 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SH3BGRP55822 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SH3BGRP55822 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SH3BGRP55822 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SH3BGRP55822 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SH3BGRP55822 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SH3BGRP55822 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SH3BGRP55822 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SH3BGRP55822 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SH3BGRP55822 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SH3BGRP55822 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SH3BGRP55822 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SH3BGRP55822 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SH3BGRP55822 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SH3BGRP55822 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SH3BGRP55822 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SH3BGRP55822 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SH3BGRP55822 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SH3BGRP55822 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SH3BGRP55822 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms