Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC13P55735 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC13P55735 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC13P55735 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC13P55735 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC13P55735 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC13P55735 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC13P55735 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC13P55735 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC13P55735 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC13P55735 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEC13P55735 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC13P55735 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC13P55735 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC13P55735 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC13P55735 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC13P55735 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC13P55735 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC13P55735 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC13P55735 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC13P55735 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC13P55735 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC13P55735 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC13P55735 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEC13P55735 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC13P55735 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC13P55735 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC13P55735 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC13P55735 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC13P55735 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC13P55735 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC13P55735 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC13P55735 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC13P55735 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC13P55735 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEC13P55735 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC13P55735 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC13P55735 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC13P55735 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC13P55735 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC13P55735 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC13P55735 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC13P55735 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC13P55735 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC13P55735 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC13P55735 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC13P55735 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC13P55735 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC13P55735 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC13P55735 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC13P55735 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC13P55735 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC13P55735 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SEC13P55735 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC13P55735 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC13P55735 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC13P55735 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC13P55735 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC13P55735 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC13P55735 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SEC13P55735 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEC13P55735 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEC13P55735 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SEC13P55735 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC13P55735 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC13P55735 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC13P55735 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC13P55735 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC13P55735 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC13P55735 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC13P55735 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC13P55735 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC13P55735 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC13P55735 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC13P55735 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC13P55735 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC13P55735 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC13P55735 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC13P55735 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC13P55735 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC13P55735 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SEC13P55735 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC13P55735 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC13P55735 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC13P55735 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC13P55735 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC13P55735 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC13P55735 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC13P55735 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC13P55735 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC13P55735 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC13P55735 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC13P55735 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC13P55735 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC13P55735 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC13P55735 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SEC13P55735 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC13P55735 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC13P55735 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEC13P55735 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms