Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CASP9P55211 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CASP9P55211 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CASP9P55211 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CASP9P55211 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CASP9P55211 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CASP9P55211 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CASP9P55211 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CASP9P55211 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CASP9P55211 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CASP9P55211 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CASP9P55211 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CASP9P55211 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CASP9P55211 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CASP9P55211 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CASP9P55211 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CASP9P55211 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CASP9P55211 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CASP9P55211 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CASP9P55211 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CASP9P55211 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CASP9P55211 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CASP9P55211 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CASP9P55211 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CASP9P55211 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CASP9P55211 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
CASP9P55211 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CASP9P55211 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CASP9P55211 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CASP9P55211 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CASP9P55211 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CASP9P55211 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CASP9P55211 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CASP9P55211 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CASP9P55211 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CASP9P55211 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CASP9P55211 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CASP9P55211 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CASP9P55211 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CASP9P55211 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CASP9P55211 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CASP9P55211 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CASP9P55211 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CASP9P55211 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CASP9P55211 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CASP9P55211 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CASP9P55211 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CASP9P55211 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CASP9P55211 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CASP9P55211 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CASP9P55211 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CASP9P55211 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CASP9P55211 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CASP9P55211 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CASP9P55211 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CASP9P55211 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CASP9P55211 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CASP9P55211 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CASP9P55211 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CASP9P55211 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CASP9P55211 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CASP9P55211 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CASP9P55211 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CASP9P55211 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CASP9P55211 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CASP9P55211 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CASP9P55211 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CASP9P55211 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CASP9P55211 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CASP9P55211 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CASP9P55211 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CASP9P55211 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CASP9P55211 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CASP9P55211 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CASP9P55211 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CASP9P55211 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CASP9P55211 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CASP9P55211 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CASP9P55211 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CASP9P55211 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CASP9P55211 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CASP9P55211 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CASP9P55211 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CASP9P55211 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CASP9P55211 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CASP9P55211 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CASP9P55211 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CASP9P55211 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CASP9P55211 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CASP9P55211 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CASP9P55211 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CASP9P55211 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
CASP9P55211 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CASP9P55211 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CASP9P55211 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
CASP9P55211 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CASP9P55211 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CASP9P55211 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CASP9P55211 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CASP9P55211 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms