Protein–RNA interactions for Protein: P55160

NCKAP1L, Nck-associated protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1LP55160 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCKAP1LP55160 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCKAP1LP55160 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCKAP1LP55160 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCKAP1LP55160 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCKAP1LP55160 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCKAP1LP55160 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCKAP1LP55160 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NCKAP1LP55160 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCKAP1LP55160 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCKAP1LP55160 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCKAP1LP55160 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCKAP1LP55160 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NCKAP1LP55160 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCKAP1LP55160 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCKAP1LP55160 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCKAP1LP55160 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCKAP1LP55160 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NCKAP1LP55160 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCKAP1LP55160 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NCKAP1LP55160 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCKAP1LP55160 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCKAP1LP55160 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCKAP1LP55160 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCKAP1LP55160 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCKAP1LP55160 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCKAP1LP55160 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCKAP1LP55160 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCKAP1LP55160 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCKAP1LP55160 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCKAP1LP55160 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCKAP1LP55160 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCKAP1LP55160 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCKAP1LP55160 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCKAP1LP55160 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCKAP1LP55160 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCKAP1LP55160 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCKAP1LP55160 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCKAP1LP55160 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCKAP1LP55160 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCKAP1LP55160 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NCKAP1LP55160 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCKAP1LP55160 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NCKAP1LP55160 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCKAP1LP55160 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCKAP1LP55160 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NCKAP1LP55160 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCKAP1LP55160 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCKAP1LP55160 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCKAP1LP55160 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCKAP1LP55160 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
NCKAP1LP55160 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NCKAP1LP55160 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCKAP1LP55160 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCKAP1LP55160 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCKAP1LP55160 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCKAP1LP55160 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NCKAP1LP55160 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCKAP1LP55160 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCKAP1LP55160 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NCKAP1LP55160 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCKAP1LP55160 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCKAP1LP55160 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCKAP1LP55160 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCKAP1LP55160 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCKAP1LP55160 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCKAP1LP55160 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCKAP1LP55160 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCKAP1LP55160 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCKAP1LP55160 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCKAP1LP55160 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCKAP1LP55160 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCKAP1LP55160 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCKAP1LP55160 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCKAP1LP55160 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCKAP1LP55160 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCKAP1LP55160 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCKAP1LP55160 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCKAP1LP55160 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCKAP1LP55160 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCKAP1LP55160 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCKAP1LP55160 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NCKAP1LP55160 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCKAP1LP55160 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCKAP1LP55160 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCKAP1LP55160 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCKAP1LP55160 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCKAP1LP55160 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCKAP1LP55160 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCKAP1LP55160 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCKAP1LP55160 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCKAP1LP55160 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCKAP1LP55160 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCKAP1LP55160 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCKAP1LP55160 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCKAP1LP55160 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCKAP1LP55160 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCKAP1LP55160 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NCKAP1LP55160 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCKAP1LP55160 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms