Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMTNP53814 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMTNP53814 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMTNP53814 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMTNP53814 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMTNP53814 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMTNP53814 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMTNP53814 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMTNP53814 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMTNP53814 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SMTNP53814 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMTNP53814 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMTNP53814 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMTNP53814 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMTNP53814 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMTNP53814 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMTNP53814 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMTNP53814 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMTNP53814 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMTNP53814 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SMTNP53814 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMTNP53814 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMTNP53814 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMTNP53814 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMTNP53814 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMTNP53814 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMTNP53814 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMTNP53814 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMTNP53814 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMTNP53814 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMTNP53814 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMTNP53814 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SMTNP53814 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SMTNP53814 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMTNP53814 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMTNP53814 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMTNP53814 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMTNP53814 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMTNP53814 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMTNP53814 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMTNP53814 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMTNP53814 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SMTNP53814 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SMTNP53814 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SMTNP53814 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SMTNP53814 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMTNP53814 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMTNP53814 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMTNP53814 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMTNP53814 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMTNP53814 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMTNP53814 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMTNP53814 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMTNP53814 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMTNP53814 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMTNP53814 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMTNP53814 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMTNP53814 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMTNP53814 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMTNP53814 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMTNP53814 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMTNP53814 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMTNP53814 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMTNP53814 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMTNP53814 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMTNP53814 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMTNP53814 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SMTNP53814 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SMTNP53814 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SMTNP53814 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SMTNP53814 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMTNP53814 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMTNP53814 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMTNP53814 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMTNP53814 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMTNP53814 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMTNP53814 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMTNP53814 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMTNP53814 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMTNP53814 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMTNP53814 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SMTNP53814 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMTNP53814 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMTNP53814 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SMTNP53814 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMTNP53814 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMTNP53814 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMTNP53814 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMTNP53814 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMTNP53814 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMTNP53814 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMTNP53814 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMTNP53814 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMTNP53814 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SMTNP53814 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMTNP53814 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMTNP53814 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SMTNP53814 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMTNP53814 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMTNP53814 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms