Protein–RNA interactions for Protein: P53794

SLC5A3, Sodium/myo-inositol cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A3P53794 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC5A3P53794 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC5A3P53794 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms