Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP2S1P53680 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms