Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NKX2-5P52952 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NKX2-5P52952 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NKX2-5P52952 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NKX2-5P52952 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NKX2-5P52952 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NKX2-5P52952 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NKX2-5P52952 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NKX2-5P52952 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NKX2-5P52952 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NKX2-5P52952 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NKX2-5P52952 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NKX2-5P52952 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NKX2-5P52952 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NKX2-5P52952 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NKX2-5P52952 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NKX2-5P52952 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NKX2-5P52952 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NKX2-5P52952 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NKX2-5P52952 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NKX2-5P52952 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NKX2-5P52952 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NKX2-5P52952 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NKX2-5P52952 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NKX2-5P52952 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NKX2-5P52952 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NKX2-5P52952 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NKX2-5P52952 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NKX2-5P52952 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NKX2-5P52952 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NKX2-5P52952 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NKX2-5P52952 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NKX2-5P52952 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NKX2-5P52952 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NKX2-5P52952 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NKX2-5P52952 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NKX2-5P52952 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NKX2-5P52952 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NKX2-5P52952 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NKX2-5P52952 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NKX2-5P52952 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NKX2-5P52952 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NKX2-5P52952 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NKX2-5P52952 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NKX2-5P52952 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NKX2-5P52952 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NKX2-5P52952 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NKX2-5P52952 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NKX2-5P52952 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NKX2-5P52952 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NKX2-5P52952 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NKX2-5P52952 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NKX2-5P52952 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NKX2-5P52952 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NKX2-5P52952 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NKX2-5P52952 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.1 ms