Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCR4P51679 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCR4P51679 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCR4P51679 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCR4P51679 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCR4P51679 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCR4P51679 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCR4P51679 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCR4P51679 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCR4P51679 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCR4P51679 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCR4P51679 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCR4P51679 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCR4P51679 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCR4P51679 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCR4P51679 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCR4P51679 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCR4P51679 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCR4P51679 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCR4P51679 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCR4P51679 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCR4P51679 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCR4P51679 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCR4P51679 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCR4P51679 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCR4P51679 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCR4P51679 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCR4P51679 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCR4P51679 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCR4P51679 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCR4P51679 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCR4P51679 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCR4P51679 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCR4P51679 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCR4P51679 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCR4P51679 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCR4P51679 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCR4P51679 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCR4P51679 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCR4P51679 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCR4P51679 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCR4P51679 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCR4P51679 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCR4P51679 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCR4P51679 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCR4P51679 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCR4P51679 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCR4P51679 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCR4P51679 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCR4P51679 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCR4P51679 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCR4P51679 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCR4P51679 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCR4P51679 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCR4P51679 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCR4P51679 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCR4P51679 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCR4P51679 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCR4P51679 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCR4P51679 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCR4P51679 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCR4P51679 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCR4P51679 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCR4P51679 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCR4P51679 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCR4P51679 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCR4P51679 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCR4P51679 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCR4P51679 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCR4P51679 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCR4P51679 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCR4P51679 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCR4P51679 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCR4P51679 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCR4P51679 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCR4P51679 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCR4P51679 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCR4P51679 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCR4P51679 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCR4P51679 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCR4P51679 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCR4P51679 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCR4P51679 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCR4P51679 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCR4P51679 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCR4P51679 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCR4P51679 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCR4P51679 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCR4P51679 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCR4P51679 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCR4P51679 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCR4P51679 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCR4P51679 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCR4P51679 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCR4P51679 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCR4P51679 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCR4P51679 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCR4P51679 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCR4P51679 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCR4P51679 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms