Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CRIP1P50238 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CRIP1P50238 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms