Protein–RNA interactions for Protein: P50213

IDH3A, Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDH3AP50213 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IDH3AP50213 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IDH3AP50213 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
IDH3AP50213 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IDH3AP50213 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IDH3AP50213 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IDH3AP50213 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IDH3AP50213 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IDH3AP50213 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IDH3AP50213 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IDH3AP50213 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IDH3AP50213 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IDH3AP50213 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IDH3AP50213 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
IDH3AP50213 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
IDH3AP50213 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IDH3AP50213 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IDH3AP50213 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IDH3AP50213 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IDH3AP50213 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IDH3AP50213 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IDH3AP50213 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IDH3AP50213 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IDH3AP50213 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IDH3AP50213 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
IDH3AP50213 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IDH3AP50213 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IDH3AP50213 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IDH3AP50213 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.31■■□□□ 1
IDH3AP50213 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IDH3AP50213 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.31■■□□□ 1
IDH3AP50213 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IDH3AP50213 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IDH3AP50213 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IDH3AP50213 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IDH3AP50213 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IDH3AP50213 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IDH3AP50213 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.3■■□□□ 1
IDH3AP50213 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IDH3AP50213 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms