Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF6P49848 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF6P49848 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF6P49848 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF6P49848 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF6P49848 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF6P49848 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF6P49848 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF6P49848 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF6P49848 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF6P49848 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF6P49848 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF6P49848 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF6P49848 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF6P49848 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF6P49848 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF6P49848 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF6P49848 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF6P49848 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF6P49848 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF6P49848 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF6P49848 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF6P49848 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF6P49848 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF6P49848 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF6P49848 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF6P49848 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF6P49848 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF6P49848 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF6P49848 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF6P49848 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF6P49848 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF6P49848 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF6P49848 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF6P49848 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF6P49848 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF6P49848 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF6P49848 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF6P49848 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF6P49848 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF6P49848 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF6P49848 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF6P49848 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF6P49848 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF6P49848 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF6P49848 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF6P49848 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF6P49848 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF6P49848 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF6P49848 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF6P49848 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF6P49848 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF6P49848 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF6P49848 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF6P49848 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF6P49848 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF6P49848 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF6P49848 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF6P49848 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF6P49848 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF6P49848 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF6P49848 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF6P49848 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF6P49848 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF6P49848 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF6P49848 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF6P49848 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF6P49848 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF6P49848 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF6P49848 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF6P49848 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF6P49848 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF6P49848 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF6P49848 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF6P49848 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF6P49848 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF6P49848 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF6P49848 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF6P49848 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF6P49848 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF6P49848 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF6P49848 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF6P49848 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF6P49848 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF6P49848 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF6P49848 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF6P49848 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF6P49848 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF6P49848 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF6P49848 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF6P49848 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF6P49848 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF6P49848 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF6P49848 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF6P49848 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF6P49848 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF6P49848 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF6P49848 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF6P49848 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF6P49848 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms