Protein–RNA interactions for Protein: P49810

PSEN2, Presenilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN2P49810 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSEN2P49810 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSEN2P49810 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSEN2P49810 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSEN2P49810 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSEN2P49810 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSEN2P49810 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSEN2P49810 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSEN2P49810 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSEN2P49810 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSEN2P49810 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSEN2P49810 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSEN2P49810 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PSEN2P49810 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSEN2P49810 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSEN2P49810 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSEN2P49810 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSEN2P49810 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSEN2P49810 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PSEN2P49810 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSEN2P49810 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSEN2P49810 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSEN2P49810 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSEN2P49810 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PSEN2P49810 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSEN2P49810 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSEN2P49810 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PSEN2P49810 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
PSEN2P49810 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PSEN2P49810 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PSEN2P49810 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PSEN2P49810 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PSEN2P49810 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PSEN2P49810 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSEN2P49810 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSEN2P49810 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSEN2P49810 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSEN2P49810 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSEN2P49810 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSEN2P49810 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSEN2P49810 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSEN2P49810 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSEN2P49810 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSEN2P49810 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSEN2P49810 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSEN2P49810 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSEN2P49810 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PSEN2P49810 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSEN2P49810 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSEN2P49810 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSEN2P49810 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSEN2P49810 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSEN2P49810 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSEN2P49810 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSEN2P49810 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSEN2P49810 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSEN2P49810 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSEN2P49810 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSEN2P49810 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSEN2P49810 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSEN2P49810 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSEN2P49810 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSEN2P49810 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PSEN2P49810 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSEN2P49810 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSEN2P49810 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSEN2P49810 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PSEN2P49810 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSEN2P49810 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSEN2P49810 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSEN2P49810 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSEN2P49810 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PSEN2P49810 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSEN2P49810 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PSEN2P49810 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PSEN2P49810 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PSEN2P49810 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSEN2P49810 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSEN2P49810 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSEN2P49810 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSEN2P49810 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms