Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLK1P49759 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLK1P49759 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLK1P49759 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLK1P49759 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLK1P49759 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLK1P49759 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLK1P49759 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLK1P49759 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLK1P49759 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLK1P49759 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLK1P49759 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLK1P49759 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLK1P49759 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLK1P49759 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLK1P49759 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLK1P49759 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLK1P49759 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLK1P49759 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLK1P49759 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CLK1P49759 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLK1P49759 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLK1P49759 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLK1P49759 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLK1P49759 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CLK1P49759 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLK1P49759 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLK1P49759 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLK1P49759 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLK1P49759 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLK1P49759 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLK1P49759 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLK1P49759 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLK1P49759 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLK1P49759 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLK1P49759 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLK1P49759 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLK1P49759 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLK1P49759 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLK1P49759 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLK1P49759 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLK1P49759 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLK1P49759 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLK1P49759 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLK1P49759 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLK1P49759 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLK1P49759 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLK1P49759 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CLK1P49759 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLK1P49759 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLK1P49759 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLK1P49759 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLK1P49759 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLK1P49759 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLK1P49759 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLK1P49759 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLK1P49759 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLK1P49759 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLK1P49759 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLK1P49759 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CLK1P49759 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CLK1P49759 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLK1P49759 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CLK1P49759 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLK1P49759 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLK1P49759 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLK1P49759 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLK1P49759 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLK1P49759 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLK1P49759 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLK1P49759 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLK1P49759 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLK1P49759 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLK1P49759 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLK1P49759 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLK1P49759 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLK1P49759 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLK1P49759 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLK1P49759 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLK1P49759 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLK1P49759 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLK1P49759 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLK1P49759 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLK1P49759 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLK1P49759 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLK1P49759 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLK1P49759 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CLK1P49759 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CLK1P49759 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CLK1P49759 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CLK1P49759 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLK1P49759 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLK1P49759 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLK1P49759 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLK1P49759 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLK1P49759 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLK1P49759 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLK1P49759 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLK1P49759 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLK1P49759 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms