Protein–RNA interactions for Protein: P49590

HARS2, Probable histidine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HARS2P49590 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HARS2P49590 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HARS2P49590 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HARS2P49590 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HARS2P49590 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HARS2P49590 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HARS2P49590 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HARS2P49590 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HARS2P49590 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HARS2P49590 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HARS2P49590 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HARS2P49590 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HARS2P49590 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HARS2P49590 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HARS2P49590 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HARS2P49590 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HARS2P49590 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HARS2P49590 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HARS2P49590 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HARS2P49590 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HARS2P49590 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HARS2P49590 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HARS2P49590 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HARS2P49590 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HARS2P49590 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HARS2P49590 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HARS2P49590 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HARS2P49590 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HARS2P49590 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HARS2P49590 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HARS2P49590 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HARS2P49590 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HARS2P49590 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HARS2P49590 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HARS2P49590 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HARS2P49590 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HARS2P49590 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HARS2P49590 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HARS2P49590 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HARS2P49590 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HARS2P49590 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HARS2P49590 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HARS2P49590 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HARS2P49590 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HARS2P49590 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HARS2P49590 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HARS2P49590 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HARS2P49590 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HARS2P49590 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HARS2P49590 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HARS2P49590 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HARS2P49590 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HARS2P49590 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HARS2P49590 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HARS2P49590 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HARS2P49590 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HARS2P49590 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HARS2P49590 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HARS2P49590 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HARS2P49590 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HARS2P49590 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HARS2P49590 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HARS2P49590 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HARS2P49590 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HARS2P49590 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HARS2P49590 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HARS2P49590 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HARS2P49590 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HARS2P49590 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HARS2P49590 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HARS2P49590 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HARS2P49590 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HARS2P49590 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HARS2P49590 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HARS2P49590 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HARS2P49590 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HARS2P49590 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HARS2P49590 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HARS2P49590 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HARS2P49590 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HARS2P49590 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HARS2P49590 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HARS2P49590 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HARS2P49590 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HARS2P49590 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HARS2P49590 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HARS2P49590 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HARS2P49590 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HARS2P49590 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HARS2P49590 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HARS2P49590 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HARS2P49590 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HARS2P49590 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HARS2P49590 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HARS2P49590 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HARS2P49590 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HARS2P49590 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HARS2P49590 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HARS2P49590 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HARS2P49590 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms