Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNNI2P48788 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNNI2P48788 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNNI2P48788 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNNI2P48788 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNNI2P48788 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNNI2P48788 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNNI2P48788 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNNI2P48788 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNNI2P48788 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNNI2P48788 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNNI2P48788 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNNI2P48788 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNNI2P48788 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNNI2P48788 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNNI2P48788 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TNNI2P48788 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNNI2P48788 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNNI2P48788 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TNNI2P48788 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNNI2P48788 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TNNI2P48788 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNNI2P48788 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNNI2P48788 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNNI2P48788 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TNNI2P48788 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNNI2P48788 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNNI2P48788 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNNI2P48788 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNNI2P48788 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TNNI2P48788 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNNI2P48788 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNNI2P48788 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNNI2P48788 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNNI2P48788 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNNI2P48788 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNNI2P48788 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNNI2P48788 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNNI2P48788 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNNI2P48788 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNNI2P48788 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNNI2P48788 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNNI2P48788 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNNI2P48788 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNNI2P48788 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNNI2P48788 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TNNI2P48788 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNNI2P48788 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNNI2P48788 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNNI2P48788 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNNI2P48788 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNNI2P48788 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNNI2P48788 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNI2P48788 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNI2P48788 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNI2P48788 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNI2P48788 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNI2P48788 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNI2P48788 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNI2P48788 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNI2P48788 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNI2P48788 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNI2P48788 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNI2P48788 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNI2P48788 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNI2P48788 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNI2P48788 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNI2P48788 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNI2P48788 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNI2P48788 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNI2P48788 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNI2P48788 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TNNI2P48788 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TNNI2P48788 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TNNI2P48788 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TNNI2P48788 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNI2P48788 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms