Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
NESP48681 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.67■■■■□ 3.78
NESP48681 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
NESP48681 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
NESP48681 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
NESP48681 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
NESP48681 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
NESP48681 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
NESP48681 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
NESP48681 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
NESP48681 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
NESP48681 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
NESP48681 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
NESP48681 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC38.66■■■■□ 3.78
NESP48681 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
NESP48681 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
NESP48681 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
NESP48681 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
NESP48681 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC38.65■■■■□ 3.78
NESP48681 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
NESP48681 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
NESP48681 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
NESP48681 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
NESP48681 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
NESP48681 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
NESP48681 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
NESP48681 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
NESP48681 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
NESP48681 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC38.64■■■■□ 3.78
NESP48681 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
NESP48681 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
NESP48681 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
NESP48681 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
NESP48681 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.78
NESP48681 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.78
NESP48681 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.78
NESP48681 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC38.63■■■■□ 3.78
NESP48681 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
NESP48681 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
NESP48681 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
NESP48681 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC38.63■■■■□ 3.77
NESP48681 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
NESP48681 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
NESP48681 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
NESP48681 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
NESP48681 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
NESP48681 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
NESP48681 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
NESP48681 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
NESP48681 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
NESP48681 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
NESP48681 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
NESP48681 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
NESP48681 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
NESP48681 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
NESP48681 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
NESP48681 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
NESP48681 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC38.6■■■■□ 3.77
NESP48681 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC38.6■■■■□ 3.77
NESP48681 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
NESP48681 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
NESP48681 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
NESP48681 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
NESP48681 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
NESP48681 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
NESP48681 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC38.59■■■■□ 3.77
NESP48681 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
NESP48681 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
NESP48681 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
NESP48681 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
NESP48681 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
NESP48681 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
NESP48681 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
NESP48681 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
NESP48681 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
NESP48681 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
NESP48681 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
NESP48681 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC38.57■■■■□ 3.76
NESP48681 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
NESP48681 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
NESP48681 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC38.56■■■■□ 3.76
NESP48681 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC38.56■■■■□ 3.76
NESP48681 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC38.56■■■■□ 3.76
NESP48681 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
NESP48681 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
NESP48681 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
NESP48681 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
NESP48681 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
NESP48681 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
NESP48681 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC38.55■■■■□ 3.76
NESP48681 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC38.55■■■■□ 3.76
NESP48681 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
NESP48681 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
NESP48681 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
NESP48681 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
NESP48681 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
NESP48681 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
NESP48681 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
NESP48681 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
NESP48681 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms