Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TM4SF4P48230 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TM4SF4P48230 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TM4SF4P48230 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TM4SF4P48230 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TM4SF4P48230 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TM4SF4P48230 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TM4SF4P48230 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TM4SF4P48230 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TM4SF4P48230 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TM4SF4P48230 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TM4SF4P48230 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TM4SF4P48230 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TM4SF4P48230 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TM4SF4P48230 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TM4SF4P48230 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TM4SF4P48230 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TM4SF4P48230 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TM4SF4P48230 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TM4SF4P48230 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TM4SF4P48230 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TM4SF4P48230 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TM4SF4P48230 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TM4SF4P48230 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TM4SF4P48230 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TM4SF4P48230 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TM4SF4P48230 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TM4SF4P48230 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TM4SF4P48230 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TM4SF4P48230 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TM4SF4P48230 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TM4SF4P48230 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TM4SF4P48230 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TM4SF4P48230 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TM4SF4P48230 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TM4SF4P48230 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TM4SF4P48230 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TM4SF4P48230 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TM4SF4P48230 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TM4SF4P48230 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TM4SF4P48230 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TM4SF4P48230 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TM4SF4P48230 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TM4SF4P48230 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TM4SF4P48230 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TM4SF4P48230 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TM4SF4P48230 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TM4SF4P48230 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TM4SF4P48230 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TM4SF4P48230 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TM4SF4P48230 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TM4SF4P48230 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TM4SF4P48230 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TM4SF4P48230 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TM4SF4P48230 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TM4SF4P48230 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TM4SF4P48230 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TM4SF4P48230 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TM4SF4P48230 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TM4SF4P48230 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TM4SF4P48230 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TM4SF4P48230 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TM4SF4P48230 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TM4SF4P48230 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TM4SF4P48230 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TM4SF4P48230 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TM4SF4P48230 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TM4SF4P48230 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TM4SF4P48230 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TM4SF4P48230 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TM4SF4P48230 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TM4SF4P48230 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TM4SF4P48230 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TM4SF4P48230 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TM4SF4P48230 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TM4SF4P48230 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TM4SF4P48230 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TM4SF4P48230 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TM4SF4P48230 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TM4SF4P48230 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TM4SF4P48230 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TM4SF4P48230 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TM4SF4P48230 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TM4SF4P48230 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TM4SF4P48230 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TM4SF4P48230 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TM4SF4P48230 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TM4SF4P48230 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TM4SF4P48230 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TM4SF4P48230 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TM4SF4P48230 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TM4SF4P48230 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TM4SF4P48230 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TM4SF4P48230 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TM4SF4P48230 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TM4SF4P48230 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TM4SF4P48230 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TM4SF4P48230 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TM4SF4P48230 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TM4SF4P48230 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms