Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GNPDA1P46926 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GNPDA1P46926 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GNPDA1P46926 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GNPDA1P46926 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GNPDA1P46926 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GNPDA1P46926 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GNPDA1P46926 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GNPDA1P46926 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GNPDA1P46926 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GNPDA1P46926 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GNPDA1P46926 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GNPDA1P46926 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GNPDA1P46926 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GNPDA1P46926 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GNPDA1P46926 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GNPDA1P46926 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GNPDA1P46926 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GNPDA1P46926 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GNPDA1P46926 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GNPDA1P46926 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GNPDA1P46926 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GNPDA1P46926 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GNPDA1P46926 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms