Protein–RNA interactions for Protein: P46778

RPL21, 60S ribosomal protein L21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL21P46778 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPL21P46778 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPL21P46778 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPL21P46778 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPL21P46778 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPL21P46778 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPL21P46778 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPL21P46778 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPL21P46778 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPL21P46778 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RPL21P46778 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPL21P46778 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPL21P46778 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPL21P46778 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPL21P46778 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RPL21P46778 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPL21P46778 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPL21P46778 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPL21P46778 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPL21P46778 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPL21P46778 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPL21P46778 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPL21P46778 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPL21P46778 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPL21P46778 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPL21P46778 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPL21P46778 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPL21P46778 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPL21P46778 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPL21P46778 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPL21P46778 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPL21P46778 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPL21P46778 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPL21P46778 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPL21P46778 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPL21P46778 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPL21P46778 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPL21P46778 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPL21P46778 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPL21P46778 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPL21P46778 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPL21P46778 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPL21P46778 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPL21P46778 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL21P46778 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL21P46778 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL21P46778 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL21P46778 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL21P46778 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL21P46778 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL21P46778 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL21P46778 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL21P46778 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL21P46778 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL21P46778 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL21P46778 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL21P46778 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL21P46778 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL21P46778 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL21P46778 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL21P46778 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL21P46778 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL21P46778 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL21P46778 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL21P46778 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL21P46778 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL21P46778 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL21P46778 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL21P46778 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL21P46778 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL21P46778 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL21P46778 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL21P46778 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL21P46778 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL21P46778 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL21P46778 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL21P46778 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL21P46778 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL21P46778 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL21P46778 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL21P46778 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL21P46778 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL21P46778 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL21P46778 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL21P46778 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL21P46778 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL21P46778 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL21P46778 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL21P46778 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL21P46778 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL21P46778 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL21P46778 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL21P46778 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL21P46778 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL21P46778 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL21P46778 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL21P46778 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL21P46778 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL21P46778 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL21P46778 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms