Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA4P43681 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA4P43681 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CHRNA4P43681 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHRNA4P43681 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHRNA4P43681 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms