Protein–RNA interactions for Protein: P43378

PTPN9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN9P43378 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN9P43378 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN9P43378 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN9P43378 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN9P43378 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN9P43378 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPN9P43378 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN9P43378 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN9P43378 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN9P43378 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN9P43378 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN9P43378 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN9P43378 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN9P43378 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN9P43378 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN9P43378 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN9P43378 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN9P43378 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN9P43378 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN9P43378 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN9P43378 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN9P43378 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPN9P43378 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN9P43378 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN9P43378 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN9P43378 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN9P43378 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN9P43378 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN9P43378 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN9P43378 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN9P43378 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN9P43378 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN9P43378 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN9P43378 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPN9P43378 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPN9P43378 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPN9P43378 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPN9P43378 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPN9P43378 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPN9P43378 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN9P43378 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN9P43378 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN9P43378 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN9P43378 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN9P43378 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN9P43378 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPN9P43378 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN9P43378 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN9P43378 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN9P43378 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN9P43378 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN9P43378 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN9P43378 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN9P43378 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN9P43378 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN9P43378 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN9P43378 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPN9P43378 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN9P43378 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN9P43378 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN9P43378 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN9P43378 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN9P43378 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN9P43378 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN9P43378 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN9P43378 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN9P43378 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN9P43378 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN9P43378 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN9P43378 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPN9P43378 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN9P43378 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN9P43378 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN9P43378 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN9P43378 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN9P43378 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN9P43378 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN9P43378 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN9P43378 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN9P43378 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN9P43378 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN9P43378 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN9P43378 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN9P43378 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN9P43378 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN9P43378 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN9P43378 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPN9P43378 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN9P43378 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN9P43378 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN9P43378 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN9P43378 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN9P43378 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN9P43378 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN9P43378 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPN9P43378 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN9P43378 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN9P43378 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN9P43378 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPN9P43378 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms