Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTHFRP42898 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MTHFRP42898 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MTHFRP42898 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MTHFRP42898 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTHFRP42898 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTHFRP42898 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTHFRP42898 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTHFRP42898 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTHFRP42898 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTHFRP42898 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTHFRP42898 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTHFRP42898 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTHFRP42898 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTHFRP42898 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTHFRP42898 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MTHFRP42898 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTHFRP42898 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTHFRP42898 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTHFRP42898 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTHFRP42898 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTHFRP42898 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTHFRP42898 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTHFRP42898 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTHFRP42898 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTHFRP42898 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MTHFRP42898 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTHFRP42898 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTHFRP42898 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTHFRP42898 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTHFRP42898 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTHFRP42898 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTHFRP42898 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTHFRP42898 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTHFRP42898 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTHFRP42898 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTHFRP42898 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTHFRP42898 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTHFRP42898 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTHFRP42898 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MTHFRP42898 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTHFRP42898 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTHFRP42898 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTHFRP42898 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MTHFRP42898 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTHFRP42898 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MTHFRP42898 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms