Protein–RNA interactions for Protein: P42858

HTT, Huntingtin, humanhuman

Predictions only

Length 3,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTTP42858 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HTTP42858 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HTTP42858 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HTTP42858 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HTTP42858 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HTTP42858 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HTTP42858 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HTTP42858 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HTTP42858 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HTTP42858 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HTTP42858 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HTTP42858 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HTTP42858 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HTTP42858 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HTTP42858 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HTTP42858 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HTTP42858 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HTTP42858 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HTTP42858 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HTTP42858 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HTTP42858 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HTTP42858 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HTTP42858 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HTTP42858 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HTTP42858 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HTTP42858 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HTTP42858 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HTTP42858 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HTTP42858 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HTTP42858 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HTTP42858 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HTTP42858 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HTTP42858 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HTTP42858 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HTTP42858 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
HTTP42858 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HTTP42858 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HTTP42858 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HTTP42858 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HTTP42858 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HTTP42858 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HTTP42858 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HTTP42858 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HTTP42858 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HTTP42858 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HTTP42858 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HTTP42858 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HTTP42858 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HTTP42858 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HTTP42858 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HTTP42858 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HTTP42858 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HTTP42858 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HTTP42858 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HTTP42858 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HTTP42858 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HTTP42858 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
HTTP42858 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HTTP42858 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HTTP42858 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HTTP42858 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HTTP42858 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
HTTP42858 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
HTTP42858 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
HTTP42858 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HTTP42858 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HTTP42858 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HTTP42858 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HTTP42858 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
HTTP42858 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HTTP42858 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HTTP42858 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HTTP42858 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HTTP42858 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HTTP42858 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HTTP42858 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HTTP42858 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HTTP42858 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HTTP42858 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HTTP42858 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HTTP42858 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HTTP42858 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HTTP42858 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HTTP42858 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HTTP42858 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HTTP42858 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HTTP42858 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HTTP42858 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HTTP42858 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HTTP42858 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HTTP42858 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HTTP42858 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HTTP42858 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HTTP42858 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HTTP42858 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HTTP42858 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HTTP42858 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HTTP42858 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HTTP42858 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HTTP42858 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms