Protein–RNA interactions for Protein: P41219

PRPH, Peripherin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPHP41219 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPHP41219 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPHP41219 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPHP41219 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPHP41219 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPHP41219 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPHP41219 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPHP41219 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPHP41219 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPHP41219 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPHP41219 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPHP41219 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPHP41219 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPHP41219 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPHP41219 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPHP41219 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPHP41219 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPHP41219 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPHP41219 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPHP41219 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPHP41219 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPHP41219 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPHP41219 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPHP41219 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPHP41219 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPHP41219 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPHP41219 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPHP41219 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPHP41219 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPHP41219 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPHP41219 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPHP41219 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPHP41219 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPHP41219 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPHP41219 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPHP41219 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPHP41219 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPHP41219 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPHP41219 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPHP41219 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPHP41219 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPHP41219 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPHP41219 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPHP41219 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPHP41219 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPHP41219 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PRPHP41219 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PRPHP41219 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PRPHP41219 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPHP41219 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPHP41219 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPHP41219 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPHP41219 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPHP41219 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPHP41219 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPHP41219 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPHP41219 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPHP41219 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPHP41219 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPHP41219 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPHP41219 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPHP41219 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPHP41219 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPHP41219 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPHP41219 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPHP41219 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPHP41219 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPHP41219 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPHP41219 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPHP41219 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPHP41219 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPHP41219 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPHP41219 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPHP41219 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPHP41219 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPHP41219 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPHP41219 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPHP41219 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPHP41219 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPHP41219 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPHP41219 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPHP41219 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPHP41219 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPHP41219 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPHP41219 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPHP41219 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPHP41219 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPHP41219 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPHP41219 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPHP41219 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPHP41219 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPHP41219 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPHP41219 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPHP41219 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPHP41219 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPHP41219 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPHP41219 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPHP41219 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPHP41219 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPHP41219 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms