Protein–RNA interactions for Protein: P40429

RPL13A, 60S ribosomal protein L13a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL13AP40429 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL13AP40429 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RPL13AP40429 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms