Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR2IP36954 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR2IP36954 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR2IP36954 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
POLR2IP36954 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR2IP36954 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR2IP36954 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR2IP36954 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR2IP36954 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR2IP36954 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR2IP36954 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR2IP36954 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR2IP36954 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR2IP36954 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR2IP36954 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR2IP36954 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR2IP36954 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR2IP36954 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR2IP36954 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
POLR2IP36954 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLR2IP36954 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR2IP36954 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms