Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHRNA7P36544 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA7P36544 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms