Protein–RNA interactions for Protein: P35251

RFC1, Replication factor C subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC1P35251 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFC1P35251 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFC1P35251 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFC1P35251 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFC1P35251 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFC1P35251 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFC1P35251 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFC1P35251 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFC1P35251 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RFC1P35251 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RFC1P35251 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RFC1P35251 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RFC1P35251 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFC1P35251 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFC1P35251 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFC1P35251 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFC1P35251 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RFC1P35251 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
RFC1P35251 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RFC1P35251 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RFC1P35251 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RFC1P35251 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RFC1P35251 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RFC1P35251 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RFC1P35251 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RFC1P35251 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RFC1P35251 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RFC1P35251 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RFC1P35251 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFC1P35251 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFC1P35251 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RFC1P35251 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFC1P35251 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFC1P35251 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFC1P35251 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFC1P35251 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFC1P35251 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFC1P35251 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFC1P35251 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFC1P35251 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFC1P35251 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFC1P35251 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFC1P35251 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFC1P35251 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFC1P35251 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFC1P35251 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFC1P35251 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFC1P35251 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RFC1P35251 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFC1P35251 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFC1P35251 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFC1P35251 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFC1P35251 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFC1P35251 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFC1P35251 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RFC1P35251 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFC1P35251 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFC1P35251 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFC1P35251 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFC1P35251 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RFC1P35251 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFC1P35251 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RFC1P35251 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFC1P35251 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFC1P35251 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RFC1P35251 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFC1P35251 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFC1P35251 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFC1P35251 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFC1P35251 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFC1P35251 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFC1P35251 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFC1P35251 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFC1P35251 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFC1P35251 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFC1P35251 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFC1P35251 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFC1P35251 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFC1P35251 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFC1P35251 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFC1P35251 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RFC1P35251 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RFC1P35251 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RFC1P35251 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RFC1P35251 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RFC1P35251 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RFC1P35251 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFC1P35251 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFC1P35251 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFC1P35251 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFC1P35251 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFC1P35251 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFC1P35251 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFC1P35251 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFC1P35251 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RFC1P35251 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFC1P35251 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFC1P35251 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFC1P35251 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFC1P35251 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms