Protein–RNA interactions for Protein: P35243

RCVRN, Recoverin, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCVRNP35243 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RCVRNP35243 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RCVRNP35243 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RCVRNP35243 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RCVRNP35243 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RCVRNP35243 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RCVRNP35243 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RCVRNP35243 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RCVRNP35243 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RCVRNP35243 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RCVRNP35243 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RCVRNP35243 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RCVRNP35243 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RCVRNP35243 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RCVRNP35243 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RCVRNP35243 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RCVRNP35243 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RCVRNP35243 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RCVRNP35243 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RCVRNP35243 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RCVRNP35243 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RCVRNP35243 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RCVRNP35243 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RCVRNP35243 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RCVRNP35243 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RCVRNP35243 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RCVRNP35243 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RCVRNP35243 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RCVRNP35243 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RCVRNP35243 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RCVRNP35243 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RCVRNP35243 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RCVRNP35243 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RCVRNP35243 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RCVRNP35243 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RCVRNP35243 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RCVRNP35243 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RCVRNP35243 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RCVRNP35243 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RCVRNP35243 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RCVRNP35243 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RCVRNP35243 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RCVRNP35243 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RCVRNP35243 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RCVRNP35243 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RCVRNP35243 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RCVRNP35243 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RCVRNP35243 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RCVRNP35243 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RCVRNP35243 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RCVRNP35243 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RCVRNP35243 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RCVRNP35243 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RCVRNP35243 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RCVRNP35243 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RCVRNP35243 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RCVRNP35243 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RCVRNP35243 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RCVRNP35243 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RCVRNP35243 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RCVRNP35243 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RCVRNP35243 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RCVRNP35243 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RCVRNP35243 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RCVRNP35243 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RCVRNP35243 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RCVRNP35243 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RCVRNP35243 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RCVRNP35243 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RCVRNP35243 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RCVRNP35243 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RCVRNP35243 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RCVRNP35243 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RCVRNP35243 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RCVRNP35243 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RCVRNP35243 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RCVRNP35243 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RCVRNP35243 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RCVRNP35243 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RCVRNP35243 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RCVRNP35243 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RCVRNP35243 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RCVRNP35243 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RCVRNP35243 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RCVRNP35243 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RCVRNP35243 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RCVRNP35243 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RCVRNP35243 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RCVRNP35243 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RCVRNP35243 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RCVRNP35243 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RCVRNP35243 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RCVRNP35243 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RCVRNP35243 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
RCVRNP35243 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RCVRNP35243 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RCVRNP35243 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RCVRNP35243 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RCVRNP35243 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RCVRNP35243 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms