Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPC1P35052 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPC1P35052 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPC1P35052 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPC1P35052 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPC1P35052 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPC1P35052 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPC1P35052 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPC1P35052 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GPC1P35052 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPC1P35052 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPC1P35052 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPC1P35052 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPC1P35052 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPC1P35052 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPC1P35052 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPC1P35052 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPC1P35052 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPC1P35052 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPC1P35052 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPC1P35052 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPC1P35052 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPC1P35052 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPC1P35052 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPC1P35052 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPC1P35052 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPC1P35052 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPC1P35052 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPC1P35052 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPC1P35052 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPC1P35052 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GPC1P35052 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GPC1P35052 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GPC1P35052 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GPC1P35052 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GPC1P35052 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GPC1P35052 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GPC1P35052 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GPC1P35052 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GPC1P35052 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GPC1P35052 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GPC1P35052 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPC1P35052 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPC1P35052 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPC1P35052 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPC1P35052 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPC1P35052 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPC1P35052 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPC1P35052 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPC1P35052 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPC1P35052 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPC1P35052 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPC1P35052 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPC1P35052 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GPC1P35052 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GPC1P35052 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GPC1P35052 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GPC1P35052 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GPC1P35052 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GPC1P35052 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GPC1P35052 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GPC1P35052 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GPC1P35052 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
GPC1P35052 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GPC1P35052 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GPC1P35052 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GPC1P35052 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GPC1P35052 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GPC1P35052 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GPC1P35052 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GPC1P35052 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GPC1P35052 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GPC1P35052 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GPC1P35052 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GPC1P35052 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GPC1P35052 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GPC1P35052 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GPC1P35052 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GPC1P35052 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GPC1P35052 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GPC1P35052 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
GPC1P35052 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
GPC1P35052 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GPC1P35052 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
GPC1P35052 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
GPC1P35052 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
GPC1P35052 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GPC1P35052 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GPC1P35052 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GPC1P35052 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GPC1P35052 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPC1P35052 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPC1P35052 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPC1P35052 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPC1P35052 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPC1P35052 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GPC1P35052 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
GPC1P35052 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GPC1P35052 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GPC1P35052 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms