Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SFNP31947 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SFNP31947 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SFNP31947 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SFNP31947 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SFNP31947 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SFNP31947 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SFNP31947 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SFNP31947 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SFNP31947 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SFNP31947 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SFNP31947 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SFNP31947 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SFNP31947 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SFNP31947 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SFNP31947 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SFNP31947 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SFNP31947 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SFNP31947 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SFNP31947 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SFNP31947 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SFNP31947 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SFNP31947 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SFNP31947 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SFNP31947 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SFNP31947 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SFNP31947 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SFNP31947 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SFNP31947 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SFNP31947 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SFNP31947 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SFNP31947 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SFNP31947 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SFNP31947 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFNP31947 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFNP31947 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFNP31947 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFNP31947 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFNP31947 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFNP31947 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFNP31947 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFNP31947 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFNP31947 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SFNP31947 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFNP31947 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFNP31947 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFNP31947 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SFNP31947 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFNP31947 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SFNP31947 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SFNP31947 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SFNP31947 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SFNP31947 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SFNP31947 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SFNP31947 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SFNP31947 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SFNP31947 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SFNP31947 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SFNP31947 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SFNP31947 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SFNP31947 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SFNP31947 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SFNP31947 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SFNP31947 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SFNP31947 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SFNP31947 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SFNP31947 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SFNP31947 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SFNP31947 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SFNP31947 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SFNP31947 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SFNP31947 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SFNP31947 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SFNP31947 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SFNP31947 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SFNP31947 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SFNP31947 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SFNP31947 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SFNP31947 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SFNP31947 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SFNP31947 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SFNP31947 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SFNP31947 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SFNP31947 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SFNP31947 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SFNP31947 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SFNP31947 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SFNP31947 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SFNP31947 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SFNP31947 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SFNP31947 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SFNP31947 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SFNP31947 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SFNP31947 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SFNP31947 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SFNP31947 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SFNP31947 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SFNP31947 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SFNP31947 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SFNP31947 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms